Vóór 1978 werd Gilgit-Baltistan afgesneden van de rest van Pakistan en de wereld vanwege het ruige terrein en het gebrek aan toegankelijke wegen. Alle wegen naar het zuiden gingen open naar de door Pakistan bestuurde staat Azad Kasjmir en in het zuidoosten richting het huidige door India beheerde Jammu en Kasjmir. In de zomer konden mensen over de bergpassen lopen om naar Rawalpindi te reizen. De snelste manier om te reizen was per vliegtuig, maar vliegreizen waren alleen toegankelijk voor een paar bevoorrechte lokale mensen en voor de Pakistaanse militaire en civiele functionarissen. Vervolgens, met de hulp van de Chinese regering, begon Pakistan met de bouw van de Karakoram Highway (KKH), die in 1978 werd voltooid. De reis van Rawalpindi/Islamabad naar Gilgit duurt ongeveer 20 tot 24 uur.
De Karakoram Highway verbindt Islamabad met Gilgit en Skardu, dat zijn de twee belangrijkste knooppunten voor bergbeklimmingsexpedities in Gilgit-Baltistan. Northern Areas Transport Corporation (NATCO) biedt bus- en jeepvervoer naar de twee hubs en verschillende andere populaire bestemmingen, meren en gletsjers in het gebied. Aardverschuivingen op de Karakoram Highway komen heel vaak voor. De Karakoram Highway verbindt Gilgit met Tashkurgan Town, Kashgar, China via Sust, de douane- en gezondheidsinspectiepost aan de kant van Gilgit-Baltistan, en de Khunjerabpas, de hoogste verharde internationale grensovergang ter wereld op 4.693 meter (15.397 ft).